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檢測儀器儀表革新的革命影響著生物醫(yī)學(xué)的發(fā)展


  來源: 儀器儀表商情網(wǎng) 時間:2015-10-15 作者:Stanford
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      此后第二年,Henderson、Agard和其他冷凍電鏡的狂熱支持者有條不紊地實現(xiàn)了各種技術(shù)改善,尤其是找到了感知電子的更好方法。在數(shù)碼相機風(fēng)靡世界很久之后,很多電子顯微鏡專家仍然偏好過時的膠片,因為它能比數(shù)字傳感器更高效地記錄電子。不過,和顯微鏡生產(chǎn)廠商一道,研究人員開發(fā)出遠超膠片和數(shù)碼相機探測器的新一代直接電子探測器。

       這些從2012年左右獲得應(yīng)用的探測器,能以每秒幾十幀的速率捕捉單一分子的速射圖像。與此同時,諸如Scheres等研究人員編寫了復(fù)雜的軟件程序,將上千幅2D圖像轉(zhuǎn)變成在很多情況下可與晶體學(xué)解析的分子圖像質(zhì)量相媲美的3D模型。

       冷凍電鏡適合能忍受電子轟擊而不會四處晃動的穩(wěn)定、大型分子,因此通常由幾十個蛋白制成的分子機器是很好的目標(biāo)。而研究證明,沒有什么比由RNA相互纏繞支撐的核糖體更加合適了。通過X射線晶體學(xué)解析核糖體結(jié)構(gòu)的方法,讓3位化學(xué)家獲得了2009年諾貝爾化學(xué)獎。過去幾年里,不同的研究團隊迅速發(fā)表了來自眾多生物體的核糖體冷凍電鏡結(jié)構(gòu),包括首個人類核糖體高分辨率模型。在由分享了2009年諾貝爾獎的Venki Rama krishnan領(lǐng)導(dǎo)的LMB實驗室,X射線晶體學(xué)在很大程度上變得無人問津。他認(rèn)為,對于大型分子來說,“冷凍電鏡將大幅取代晶體學(xué)技術(shù)的預(yù)測是可靠的”。

今年5月,加拿大多倫多大學(xué)結(jié)構(gòu)生物學(xué)家John Rubinstein和他的同事利用約10萬幅冷凍電鏡圖像,創(chuàng)建了一種名為V-ATPase、形狀類似轉(zhuǎn)子的酶的“分子影片”。V-ATPase通過燃燒三磷酸腺苷(ATP)推動質(zhì)子進出細(xì)胞液泡。“我們看到的是一切事情都在靈活進行。”Rubinstein說,“它在彎曲、扭動和變形。”在他看來,這種酶的靈活性能幫助其高效傳遞ATP釋放的能量。

       統(tǒng)治結(jié)構(gòu)生物學(xué)領(lǐng)域

       像任何新興領(lǐng)域一樣,冷凍電鏡領(lǐng)域也有著成長的煩惱。一些專家擔(dān)心,競相利用此項技術(shù)的研究人員會產(chǎn)生有問題的結(jié)果。2013年發(fā)表的一種艾滋病病毒表面蛋白的結(jié)構(gòu),便受到科學(xué)家的質(zhì)疑。他們認(rèn)為,用于構(gòu)建模型的圖像是白噪聲。從那以后,雖然其他團隊產(chǎn)生的X射線和冷凍電鏡模型對原始模型提出了挑戰(zhàn),但這些研究人員一直堅守他們的成果。

     今年6月,在高登會議上,想要更多質(zhì)量控制的研究人員通過一項決議,督促各期刊為審稿人提供關(guān)于冷凍電鏡結(jié)構(gòu)如何被創(chuàng)建的細(xì)節(jié)資料。

      成本也會減緩此項技術(shù)的擴散。據(jù)Scheres估算,LMB每天花費約3000英鎊運行其冷凍電鏡設(shè)備,還要加上1000英鎊的電費。大部分電費是由儲存和處理圖像所需的計算機產(chǎn)生的。“對于很多實驗室來說,這是一項很高的開支?!?/span>

      為了讓冷凍電鏡的使用更加便利,一些資助者建立了研究人員能預(yù)定時間的共享設(shè)備。霍華德·休斯醫(yī)學(xué)研究所(HHMI)在其弗吉尼亞州珍利亞農(nóng)場校區(qū)運營著一個對HHMI資助的研究人員開放的冷凍電鏡實驗室。在英國,由政府和惠康基金會資助的一臺全國性冷凍電鏡設(shè)備,今年在牛津附近的迪德科特開始運行?!叭藗兿胍私饫鋬鲭婄R,已成為當(dāng)下的一股浪潮?!睅椭⑸鲜鲈O(shè)備的倫敦大學(xué)伯克貝克學(xué)院結(jié)構(gòu)生物學(xué)家HelenSaibil表示。

      追趕這一浪潮的還有紐約洛克菲勒大學(xué)生物物理學(xué)家RodMacKinnon。他因確定了特定離子通道的晶體結(jié)構(gòu)而共同分享了2003年諾貝爾化學(xué)獎,但如今卻在深入研究冷凍電鏡?!拔艺幵趯W(xué)習(xí)曲線的陡坡上,而這總是令我興奮不已?!盡acKinnon希望利用冷凍電鏡研究離子通道是如何打開和關(guān)閉的。

      當(dāng)Henderson在1997年反駁說冷凍電鏡將統(tǒng)治結(jié)構(gòu)生物學(xué)世界時,他或許是在口是心非。但將近20年以后,他的預(yù)言已不像當(dāng)時看上去的那么夸張?!叭绻^續(xù)發(fā)展下去,并且所有技術(shù)問題都得到解決,冷凍電鏡確實會成為一種占據(jù)統(tǒng)治地位的技術(shù),而不僅僅是第一選擇?!盚enderson說,“我們或許已經(jīng)成功了一半?!?/span>

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